Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01641 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01641 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01641 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01641 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01641 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01641 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01641 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
P01641 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
P01641 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
P01641 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
P01641 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
P01641 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01641 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01641 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
P01641 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01641 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01641 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
P01641 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01641 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01641 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01641 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01641 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01641 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01641 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01641 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01641 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01641 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01641 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01641 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01641 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01641 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01641 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01641 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01641 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01641 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01641 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01641 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01641 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01641 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01641 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01641 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01641 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01641 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01641 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01641 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01641 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01641 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
P01641 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01641 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01641 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01641 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01641 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01641 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
P01641 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01641 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01641 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01641 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01641 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01641 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01641 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01641 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01641 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01641 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01641 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01641 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01641 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01641 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
P01641 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01641 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01641 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
P01641 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01641 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01641 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01641 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01641 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01641 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01641 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01641 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01641 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01641 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01641 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01641 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01641 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01641 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01641 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01641 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01641 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
P01641 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01641 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01641 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01641 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01641 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01641 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01641 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01641 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01641 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01641 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01641 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01641 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms