Protein–RNA interactions for Protein: P01572

Ifna1, Interferon alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna1P01572 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna1P01572 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna1P01572 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna1P01572 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna1P01572 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna1P01572 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna1P01572 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna1P01572 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna1P01572 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna1P01572 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna1P01572 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna1P01572 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna1P01572 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna1P01572 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna1P01572 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna1P01572 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna1P01572 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna1P01572 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna1P01572 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna1P01572 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna1P01572 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna1P01572 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ifna1P01572 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna1P01572 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna1P01572 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna1P01572 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna1P01572 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna1P01572 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna1P01572 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna1P01572 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna1P01572 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna1P01572 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna1P01572 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna1P01572 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna1P01572 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna1P01572 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna1P01572 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna1P01572 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna1P01572 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna1P01572 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ifna1P01572 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms