Protein–RNA interactions for Protein: P01029

C4b, Complement C4-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,738 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4bP01029 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C4bP01029 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C4bP01029 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C4bP01029 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C4bP01029 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C4bP01029 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C4bP01029 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C4bP01029 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
C4bP01029 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
C4bP01029 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C4bP01029 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C4bP01029 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C4bP01029 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C4bP01029 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
C4bP01029 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C4bP01029 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C4bP01029 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C4bP01029 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C4bP01029 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C4bP01029 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C4bP01029 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
C4bP01029 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
C4bP01029 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C4bP01029 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C4bP01029 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C4bP01029 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C4bP01029 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C4bP01029 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C4bP01029 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C4bP01029 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C4bP01029 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C4bP01029 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C4bP01029 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C4bP01029 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C4bP01029 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C4bP01029 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C4bP01029 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C4bP01029 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C4bP01029 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C4bP01029 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C4bP01029 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C4bP01029 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C4bP01029 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C4bP01029 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C4bP01029 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C4bP01029 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C4bP01029 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C4bP01029 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C4bP01029 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C4bP01029 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C4bP01029 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C4bP01029 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C4bP01029 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C4bP01029 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4bP01029 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4bP01029 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
C4bP01029 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4bP01029 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
C4bP01029 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4bP01029 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4bP01029 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4bP01029 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4bP01029 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4bP01029 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4bP01029 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
C4bP01029 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C4bP01029 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C4bP01029 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C4bP01029 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C4bP01029 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
C4bP01029 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C4bP01029 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C4bP01029 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C4bP01029 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C4bP01029 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C4bP01029 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C4bP01029 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C4bP01029 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C4bP01029 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C4bP01029 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C4bP01029 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
C4bP01029 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C4bP01029 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C4bP01029 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C4bP01029 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C4bP01029 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C4bP01029 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C4bP01029 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
C4bP01029 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C4bP01029 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
C4bP01029 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C4bP01029 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C4bP01029 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C4bP01029 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C4bP01029 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C4bP01029 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C4bP01029 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C4bP01029 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C4bP01029 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
C4bP01029 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms