Protein–RNA interactions for Protein: O89026

Robo1, Roundabout homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo1O89026 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Robo1O89026 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Robo1O89026 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Robo1O89026 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Robo1O89026 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Robo1O89026 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Robo1O89026 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Robo1O89026 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Robo1O89026 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Robo1O89026 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Robo1O89026 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Robo1O89026 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Robo1O89026 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Robo1O89026 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Robo1O89026 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Robo1O89026 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Robo1O89026 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Robo1O89026 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Robo1O89026 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Robo1O89026 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Robo1O89026 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Robo1O89026 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Robo1O89026 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Robo1O89026 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Robo1O89026 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Robo1O89026 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Robo1O89026 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Robo1O89026 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Robo1O89026 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Robo1O89026 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Robo1O89026 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Robo1O89026 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Robo1O89026 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Robo1O89026 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Robo1O89026 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Robo1O89026 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Robo1O89026 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Robo1O89026 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Robo1O89026 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Robo1O89026 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Robo1O89026 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Robo1O89026 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Robo1O89026 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Robo1O89026 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Robo1O89026 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Robo1O89026 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Robo1O89026 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Robo1O89026 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Robo1O89026 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Robo1O89026 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Robo1O89026 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Robo1O89026 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Robo1O89026 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Robo1O89026 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Robo1O89026 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Robo1O89026 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Robo1O89026 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Robo1O89026 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Robo1O89026 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Robo1O89026 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Robo1O89026 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Robo1O89026 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Robo1O89026 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Robo1O89026 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Robo1O89026 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Robo1O89026 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Robo1O89026 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Robo1O89026 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Robo1O89026 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Robo1O89026 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Robo1O89026 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms