Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MscO88940 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MscO88940 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MscO88940 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MscO88940 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MscO88940 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MscO88940 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MscO88940 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MscO88940 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MscO88940 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MscO88940 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MscO88940 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MscO88940 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MscO88940 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MscO88940 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MscO88940 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MscO88940 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MscO88940 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MscO88940 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MscO88940 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MscO88940 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MscO88940 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MscO88940 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MscO88940 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MscO88940 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MscO88940 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MscO88940 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MscO88940 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MscO88940 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MscO88940 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MscO88940 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MscO88940 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MscO88940 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MscO88940 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MscO88940 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MscO88940 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MscO88940 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MscO88940 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MscO88940 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MscO88940 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MscO88940 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MscO88940 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MscO88940 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MscO88940 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MscO88940 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MscO88940 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MscO88940 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MscO88940 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MscO88940 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MscO88940 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MscO88940 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MscO88940 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MscO88940 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MscO88940 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MscO88940 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MscO88940 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MscO88940 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MscO88940 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MscO88940 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MscO88940 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MscO88940 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MscO88940 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MscO88940 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MscO88940 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MscO88940 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MscO88940 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MscO88940 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MscO88940 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MscO88940 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MscO88940 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MscO88940 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MscO88940 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MscO88940 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MscO88940 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MscO88940 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MscO88940 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MscO88940 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MscO88940 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MscO88940 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MscO88940 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MscO88940 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MscO88940 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MscO88940 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MscO88940 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MscO88940 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MscO88940 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MscO88940 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MscO88940 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MscO88940 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MscO88940 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MscO88940 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MscO88940 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MscO88940 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MscO88940 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MscO88940 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MscO88940 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MscO88940 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MscO88940 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MscO88940 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MscO88940 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms