Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CcnkO88874 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CcnkO88874 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CcnkO88874 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcnkO88874 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms