Protein–RNA interactions for Protein: O88602

Cacng2, Voltage-dependent calcium channel gamma-2 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng2O88602 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng2O88602 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng2O88602 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng2O88602 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng2O88602 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng2O88602 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng2O88602 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng2O88602 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng2O88602 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng2O88602 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng2O88602 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng2O88602 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng2O88602 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng2O88602 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng2O88602 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng2O88602 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng2O88602 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng2O88602 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacng2O88602 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacng2O88602 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacng2O88602 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacng2O88602 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacng2O88602 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacng2O88602 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacng2O88602 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacng2O88602 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacng2O88602 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacng2O88602 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.1 ms