Protein–RNA interactions for Protein: O88587

Comt, Catechol O-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ComtO88587 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ComtO88587 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ComtO88587 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ComtO88587 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ComtO88587 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ComtO88587 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ComtO88587 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ComtO88587 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ComtO88587 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ComtO88587 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ComtO88587 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ComtO88587 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ComtO88587 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ComtO88587 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ComtO88587 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ComtO88587 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ComtO88587 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ComtO88587 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ComtO88587 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ComtO88587 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ComtO88587 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ComtO88587 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ComtO88587 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ComtO88587 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ComtO88587 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ComtO88587 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ComtO88587 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ComtO88587 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ComtO88587 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ComtO88587 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ComtO88587 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ComtO88587 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ComtO88587 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ComtO88587 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ComtO88587 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ComtO88587 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ComtO88587 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ComtO88587 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ComtO88587 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ComtO88587 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ComtO88587 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ComtO88587 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ComtO88587 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ComtO88587 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ComtO88587 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ComtO88587 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ComtO88587 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ComtO88587 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ComtO88587 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ComtO88587 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ComtO88587 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ComtO88587 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ComtO88587 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ComtO88587 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ComtO88587 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ComtO88587 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ComtO88587 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ComtO88587 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ComtO88587 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ComtO88587 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ComtO88587 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ComtO88587 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ComtO88587 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ComtO88587 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ComtO88587 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ComtO88587 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ComtO88587 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ComtO88587 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ComtO88587 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ComtO88587 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ComtO88587 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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ComtO88587 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ComtO88587 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ComtO88587 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ComtO88587 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ComtO88587 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ComtO88587 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ComtO88587 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ComtO88587 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ComtO88587 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ComtO88587 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ComtO88587 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ComtO88587 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ComtO88587 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ComtO88587 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ComtO88587 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ComtO88587 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ComtO88587 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ComtO88587 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ComtO88587 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ComtO88587 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ComtO88587 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ComtO88587 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ComtO88587 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ComtO88587 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ComtO88587 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ComtO88587 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ComtO88587 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ComtO88587 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms