Protein–RNA interactions for Protein: O70546

Kdm6a, Lysine-specific demethylase 6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm6aO70546 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Kdm6aO70546 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm6aO70546 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm6aO70546 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm6aO70546 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm6aO70546 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm6aO70546 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm6aO70546 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm6aO70546 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm6aO70546 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm6aO70546 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm6aO70546 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm6aO70546 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm6aO70546 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm6aO70546 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm6aO70546 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm6aO70546 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm6aO70546 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm6aO70546 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Kdm6aO70546 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm6aO70546 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm6aO70546 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm6aO70546 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm6aO70546 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm6aO70546 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm6aO70546 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm6aO70546 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm6aO70546 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm6aO70546 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm6aO70546 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm6aO70546 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm6aO70546 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm6aO70546 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm6aO70546 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm6aO70546 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm6aO70546 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm6aO70546 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm6aO70546 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm6aO70546 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm6aO70546 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm6aO70546 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm6aO70546 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm6aO70546 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm6aO70546 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm6aO70546 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm6aO70546 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm6aO70546 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm6aO70546 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm6aO70546 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm6aO70546 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm6aO70546 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm6aO70546 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm6aO70546 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm6aO70546 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm6aO70546 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm6aO70546 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm6aO70546 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm6aO70546 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm6aO70546 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm6aO70546 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm6aO70546 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms