Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms