Protein–RNA interactions for Protein: O55230

Rad51d, DNA repair protein RAD51 homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51dO55230 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad51dO55230 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms