Protein–RNA interactions for Protein: O55226

Chad, Chondroadherin, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChadO55226 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ChadO55226 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ChadO55226 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChadO55226 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChadO55226 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChadO55226 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChadO55226 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChadO55226 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChadO55226 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChadO55226 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChadO55226 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChadO55226 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChadO55226 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChadO55226 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChadO55226 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ChadO55226 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChadO55226 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChadO55226 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChadO55226 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChadO55226 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChadO55226 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChadO55226 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChadO55226 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChadO55226 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChadO55226 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ChadO55226 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChadO55226 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChadO55226 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChadO55226 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChadO55226 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ChadO55226 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ChadO55226 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ChadO55226 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ChadO55226 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ChadO55226 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ChadO55226 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChadO55226 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChadO55226 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChadO55226 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChadO55226 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChadO55226 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ChadO55226 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ChadO55226 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChadO55226 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChadO55226 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChadO55226 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChadO55226 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChadO55226 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ChadO55226 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChadO55226 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChadO55226 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ChadO55226 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ChadO55226 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ChadO55226 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChadO55226 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChadO55226 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ChadO55226 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ChadO55226 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChadO55226 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChadO55226 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChadO55226 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ChadO55226 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ChadO55226 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChadO55226 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChadO55226 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChadO55226 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChadO55226 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChadO55226 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ChadO55226 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChadO55226 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ChadO55226 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChadO55226 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ChadO55226 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChadO55226 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChadO55226 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChadO55226 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChadO55226 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChadO55226 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChadO55226 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChadO55226 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChadO55226 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChadO55226 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChadO55226 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChadO55226 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChadO55226 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChadO55226 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChadO55226 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChadO55226 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChadO55226 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChadO55226 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChadO55226 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChadO55226 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChadO55226 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChadO55226 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChadO55226 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChadO55226 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChadO55226 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChadO55226 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChadO55226 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ChadO55226 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms