Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Supt5hO55201 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Supt5hO55201 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Supt5hO55201 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Supt5hO55201 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Supt5hO55201 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Supt5hO55201 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Supt5hO55201 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Supt5hO55201 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Supt5hO55201 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Supt5hO55201 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Supt5hO55201 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Supt5hO55201 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Supt5hO55201 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Supt5hO55201 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Supt5hO55201 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Supt5hO55201 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Supt5hO55201 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Supt5hO55201 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Supt5hO55201 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Supt5hO55201 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Supt5hO55201 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Supt5hO55201 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Supt5hO55201 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Supt5hO55201 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Supt5hO55201 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Supt5hO55201 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Supt5hO55201 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Supt5hO55201 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Supt5hO55201 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Supt5hO55201 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Supt5hO55201 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Supt5hO55201 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Supt5hO55201 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Supt5hO55201 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Supt5hO55201 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Supt5hO55201 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Supt5hO55201 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Supt5hO55201 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Supt5hO55201 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Supt5hO55201 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Supt5hO55201 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Supt5hO55201 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Supt5hO55201 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Supt5hO55201 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Supt5hO55201 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Supt5hO55201 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Supt5hO55201 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Supt5hO55201 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Supt5hO55201 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Supt5hO55201 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Supt5hO55201 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Supt5hO55201 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Supt5hO55201 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Supt5hO55201 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Supt5hO55201 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Supt5hO55201 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Supt5hO55201 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Supt5hO55201 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Supt5hO55201 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
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