Protein–RNA interactions for Protein: O55131

Sept7, Septin-7, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept7O55131 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sept7O55131 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sept7O55131 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sept7O55131 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sept7O55131 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sept7O55131 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sept7O55131 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sept7O55131 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sept7O55131 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sept7O55131 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sept7O55131 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sept7O55131 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sept7O55131 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Sept7O55131 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sept7O55131 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sept7O55131 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sept7O55131 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Sept7O55131 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sept7O55131 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sept7O55131 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sept7O55131 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sept7O55131 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sept7O55131 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sept7O55131 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sept7O55131 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sept7O55131 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sept7O55131 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sept7O55131 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sept7O55131 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sept7O55131 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Sept7O55131 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sept7O55131 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sept7O55131 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sept7O55131 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sept7O55131 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Sept7O55131 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sept7O55131 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sept7O55131 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sept7O55131 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Sept7O55131 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sept7O55131 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sept7O55131 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sept7O55131 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sept7O55131 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sept7O55131 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sept7O55131 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sept7O55131 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sept7O55131 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Sept7O55131 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sept7O55131 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Sept7O55131 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sept7O55131 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sept7O55131 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sept7O55131 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sept7O55131 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sept7O55131 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sept7O55131 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sept7O55131 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Sept7O55131 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Sept7O55131 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sept7O55131 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sept7O55131 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sept7O55131 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sept7O55131 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sept7O55131 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sept7O55131 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sept7O55131 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sept7O55131 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sept7O55131 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sept7O55131 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sept7O55131 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sept7O55131 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sept7O55131 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sept7O55131 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sept7O55131 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sept7O55131 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sept7O55131 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sept7O55131 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sept7O55131 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sept7O55131 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sept7O55131 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sept7O55131 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sept7O55131 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sept7O55131 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sept7O55131 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sept7O55131 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sept7O55131 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sept7O55131 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Sept7O55131 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sept7O55131 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sept7O55131 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sept7O55131 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sept7O55131 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sept7O55131 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sept7O55131 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sept7O55131 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sept7O55131 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sept7O55131 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sept7O55131 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sept7O55131 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms