Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms