Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms