Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms