Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NlkO54949 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NlkO54949 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NlkO54949 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NlkO54949 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NlkO54949 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NlkO54949 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NlkO54949 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NlkO54949 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NlkO54949 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NlkO54949 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NlkO54949 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NlkO54949 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NlkO54949 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NlkO54949 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NlkO54949 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NlkO54949 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NlkO54949 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NlkO54949 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NlkO54949 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NlkO54949 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NlkO54949 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NlkO54949 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NlkO54949 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NlkO54949 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NlkO54949 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NlkO54949 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NlkO54949 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NlkO54949 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NlkO54949 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NlkO54949 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NlkO54949 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NlkO54949 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NlkO54949 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NlkO54949 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NlkO54949 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NlkO54949 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NlkO54949 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NlkO54949 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NlkO54949 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NlkO54949 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NlkO54949 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NlkO54949 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NlkO54949 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NlkO54949 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NlkO54949 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NlkO54949 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NlkO54949 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NlkO54949 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NlkO54949 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NlkO54949 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NlkO54949 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NlkO54949 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NlkO54949 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NlkO54949 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NlkO54949 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NlkO54949 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NlkO54949 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NlkO54949 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NlkO54949 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NlkO54949 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NlkO54949 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NlkO54949 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NlkO54949 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NlkO54949 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NlkO54949 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NlkO54949 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NlkO54949 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NlkO54949 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NlkO54949 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NlkO54949 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NlkO54949 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NlkO54949 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NlkO54949 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NlkO54949 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NlkO54949 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NlkO54949 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NlkO54949 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NlkO54949 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NlkO54949 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NlkO54949 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NlkO54949 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NlkO54949 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NlkO54949 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NlkO54949 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NlkO54949 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NlkO54949 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NlkO54949 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NlkO54949 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NlkO54949 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NlkO54949 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NlkO54949 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NlkO54949 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NlkO54949 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NlkO54949 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NlkO54949 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NlkO54949 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NlkO54949 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NlkO54949 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NlkO54949 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms