Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DffaO54786 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DffaO54786 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DffaO54786 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DffaO54786 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DffaO54786 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DffaO54786 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DffaO54786 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DffaO54786 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DffaO54786 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DffaO54786 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DffaO54786 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DffaO54786 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DffaO54786 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DffaO54786 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DffaO54786 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DffaO54786 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DffaO54786 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DffaO54786 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DffaO54786 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DffaO54786 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DffaO54786 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DffaO54786 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DffaO54786 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DffaO54786 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DffaO54786 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DffaO54786 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DffaO54786 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DffaO54786 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DffaO54786 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DffaO54786 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DffaO54786 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DffaO54786 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DffaO54786 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DffaO54786 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DffaO54786 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DffaO54786 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DffaO54786 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DffaO54786 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DffaO54786 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DffaO54786 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DffaO54786 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DffaO54786 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DffaO54786 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DffaO54786 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DffaO54786 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DffaO54786 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DffaO54786 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DffaO54786 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DffaO54786 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
DffaO54786 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DffaO54786 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DffaO54786 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DffaO54786 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DffaO54786 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DffaO54786 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DffaO54786 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DffaO54786 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DffaO54786 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DffaO54786 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DffaO54786 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DffaO54786 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DffaO54786 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DffaO54786 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DffaO54786 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DffaO54786 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DffaO54786 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DffaO54786 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DffaO54786 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DffaO54786 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
DffaO54786 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DffaO54786 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DffaO54786 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
DffaO54786 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
DffaO54786 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DffaO54786 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
DffaO54786 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DffaO54786 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DffaO54786 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DffaO54786 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DffaO54786 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DffaO54786 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DffaO54786 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DffaO54786 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DffaO54786 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DffaO54786 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
DffaO54786 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DffaO54786 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DffaO54786 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DffaO54786 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DffaO54786 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
DffaO54786 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DffaO54786 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DffaO54786 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DffaO54786 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DffaO54786 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DffaO54786 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DffaO54786 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DffaO54786 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DffaO54786 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms