Protein–RNA interactions for Protein: O54689

Ccr6, C-C chemokine receptor type 6, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr6O54689 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr6O54689 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccr6O54689 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccr6O54689 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccr6O54689 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccr6O54689 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccr6O54689 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccr6O54689 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccr6O54689 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccr6O54689 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccr6O54689 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccr6O54689 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccr6O54689 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccr6O54689 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccr6O54689 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccr6O54689 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccr6O54689 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccr6O54689 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccr6O54689 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccr6O54689 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccr6O54689 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccr6O54689 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccr6O54689 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccr6O54689 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccr6O54689 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccr6O54689 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccr6O54689 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccr6O54689 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccr6O54689 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccr6O54689 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccr6O54689 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccr6O54689 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccr6O54689 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccr6O54689 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccr6O54689 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccr6O54689 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccr6O54689 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccr6O54689 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccr6O54689 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccr6O54689 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccr6O54689 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccr6O54689 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccr6O54689 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ccr6O54689 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccr6O54689 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccr6O54689 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccr6O54689 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccr6O54689 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccr6O54689 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccr6O54689 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccr6O54689 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccr6O54689 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccr6O54689 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccr6O54689 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccr6O54689 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccr6O54689 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccr6O54689 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccr6O54689 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccr6O54689 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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Ccr6O54689 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccr6O54689 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ccr6O54689 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccr6O54689 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccr6O54689 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ccr6O54689 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccr6O54689 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccr6O54689 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccr6O54689 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccr6O54689 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ccr6O54689 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccr6O54689 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccr6O54689 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccr6O54689 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccr6O54689 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccr6O54689 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccr6O54689 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccr6O54689 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccr6O54689 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccr6O54689 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccr6O54689 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccr6O54689 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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