Protein–RNA interactions for Protein: O35385

Ppef2, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 2, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppef2O35385 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms