Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms