Protein–RNA interactions for Protein: O35137

Alx4, Homeobox protein aristaless-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx4O35137 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alx4O35137 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alx4O35137 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Alx4O35137 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Alx4O35137 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Alx4O35137 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alx4O35137 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alx4O35137 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alx4O35137 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Alx4O35137 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alx4O35137 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Alx4O35137 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alx4O35137 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alx4O35137 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alx4O35137 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alx4O35137 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alx4O35137 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Alx4O35137 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alx4O35137 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alx4O35137 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alx4O35137 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alx4O35137 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alx4O35137 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alx4O35137 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alx4O35137 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alx4O35137 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alx4O35137 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Alx4O35137 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alx4O35137 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alx4O35137 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alx4O35137 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alx4O35137 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alx4O35137 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alx4O35137 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alx4O35137 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alx4O35137 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alx4O35137 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alx4O35137 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alx4O35137 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Alx4O35137 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alx4O35137 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alx4O35137 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alx4O35137 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alx4O35137 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alx4O35137 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.3 ms