Protein–RNA interactions for Protein: O35111

Kcnk3, Potassium channel subfamily K member 3, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk3O35111 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnk3O35111 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnk3O35111 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnk3O35111 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnk3O35111 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnk3O35111 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnk3O35111 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnk3O35111 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnk3O35111 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnk3O35111 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnk3O35111 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnk3O35111 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Kcnk3O35111 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnk3O35111 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnk3O35111 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnk3O35111 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnk3O35111 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnk3O35111 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnk3O35111 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnk3O35111 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnk3O35111 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnk3O35111 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnk3O35111 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnk3O35111 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnk3O35111 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnk3O35111 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnk3O35111 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnk3O35111 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnk3O35111 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnk3O35111 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnk3O35111 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnk3O35111 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnk3O35111 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnk3O35111 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Kcnk3O35111 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Kcnk3O35111 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Kcnk3O35111 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Kcnk3O35111 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnk3O35111 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnk3O35111 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnk3O35111 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnk3O35111 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnk3O35111 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnk3O35111 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnk3O35111 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnk3O35111 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnk3O35111 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnk3O35111 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnk3O35111 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnk3O35111 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnk3O35111 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnk3O35111 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnk3O35111 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnk3O35111 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnk3O35111 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnk3O35111 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnk3O35111 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnk3O35111 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnk3O35111 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Kcnk3O35111 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Kcnk3O35111 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnk3O35111 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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