Protein–RNA interactions for Protein: O09127

Epha8, Ephrin type-A receptor 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha8O09127 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Epha8O09127 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Epha8O09127 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Epha8O09127 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Epha8O09127 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Epha8O09127 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Epha8O09127 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Epha8O09127 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Epha8O09127 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Epha8O09127 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Epha8O09127 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Epha8O09127 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Epha8O09127 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Epha8O09127 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epha8O09127 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epha8O09127 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epha8O09127 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epha8O09127 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epha8O09127 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Epha8O09127 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.3 ms