Protein–RNA interactions for Protein: O09000

Ncoa3, Nuclear receptor coactivator 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa3O09000 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ncoa3O09000 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ncoa3O09000 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ncoa3O09000 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ncoa3O09000 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ncoa3O09000 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ncoa3O09000 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ncoa3O09000 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ncoa3O09000 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ncoa3O09000 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ncoa3O09000 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ncoa3O09000 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ncoa3O09000 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ncoa3O09000 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ncoa3O09000 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ncoa3O09000 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ncoa3O09000 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ncoa3O09000 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ncoa3O09000 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Ncoa3O09000 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Ncoa3O09000 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ncoa3O09000 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ncoa3O09000 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ncoa3O09000 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ncoa3O09000 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ncoa3O09000 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ncoa3O09000 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ncoa3O09000 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ncoa3O09000 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ncoa3O09000 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ncoa3O09000 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ncoa3O09000 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Ncoa3O09000 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ncoa3O09000 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Ncoa3O09000 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ncoa3O09000 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ncoa3O09000 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ncoa3O09000 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ncoa3O09000 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms