Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps1O08983 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps1O08983 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps1O08983 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps1O08983 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps1O08983 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps1O08983 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps1O08983 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps1O08983 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps1O08983 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps1O08983 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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