Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MttpO08601 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MttpO08601 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MttpO08601 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MttpO08601 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MttpO08601 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MttpO08601 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MttpO08601 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MttpO08601 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MttpO08601 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MttpO08601 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MttpO08601 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MttpO08601 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MttpO08601 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MttpO08601 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MttpO08601 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MttpO08601 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MttpO08601 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MttpO08601 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MttpO08601 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MttpO08601 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MttpO08601 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MttpO08601 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MttpO08601 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
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MttpO08601 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MttpO08601 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MttpO08601 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MttpO08601 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MttpO08601 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MttpO08601 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MttpO08601 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MttpO08601 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MttpO08601 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MttpO08601 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MttpO08601 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MttpO08601 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MttpO08601 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MttpO08601 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MttpO08601 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MttpO08601 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MttpO08601 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MttpO08601 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MttpO08601 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MttpO08601 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MttpO08601 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MttpO08601 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MttpO08601 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MttpO08601 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MttpO08601 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MttpO08601 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MttpO08601 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MttpO08601 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MttpO08601 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MttpO08601 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MttpO08601 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MttpO08601 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MttpO08601 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MttpO08601 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MttpO08601 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MttpO08601 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MttpO08601 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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MttpO08601 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MttpO08601 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MttpO08601 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MttpO08601 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MttpO08601 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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MttpO08601 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MttpO08601 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MttpO08601 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MttpO08601 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MttpO08601 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MttpO08601 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MttpO08601 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MttpO08601 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MttpO08601 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MttpO08601 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MttpO08601 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MttpO08601 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MttpO08601 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MttpO08601 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MttpO08601 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MttpO08601 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MttpO08601 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MttpO08601 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MttpO08601 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MttpO08601 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MttpO08601 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MttpO08601 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MttpO08601 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MttpO08601 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MttpO08601 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MttpO08601 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MttpO08601 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MttpO08601 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MttpO08601 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms