Protein–RNA interactions for Protein: O08585

Clta, Clathrin light chain A, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltaO08585 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CltaO08585 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CltaO08585 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CltaO08585 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CltaO08585 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CltaO08585 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CltaO08585 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CltaO08585 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CltaO08585 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CltaO08585 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CltaO08585 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CltaO08585 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CltaO08585 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CltaO08585 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CltaO08585 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CltaO08585 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CltaO08585 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CltaO08585 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CltaO08585 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CltaO08585 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CltaO08585 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CltaO08585 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CltaO08585 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CltaO08585 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CltaO08585 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CltaO08585 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CltaO08585 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CltaO08585 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CltaO08585 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CltaO08585 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CltaO08585 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CltaO08585 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CltaO08585 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CltaO08585 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CltaO08585 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CltaO08585 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CltaO08585 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CltaO08585 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CltaO08585 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CltaO08585 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CltaO08585 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CltaO08585 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CltaO08585 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CltaO08585 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CltaO08585 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CltaO08585 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CltaO08585 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CltaO08585 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CltaO08585 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CltaO08585 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CltaO08585 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CltaO08585 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CltaO08585 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CltaO08585 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CltaO08585 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CltaO08585 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CltaO08585 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CltaO08585 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CltaO08585 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CltaO08585 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CltaO08585 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CltaO08585 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CltaO08585 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CltaO08585 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CltaO08585 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CltaO08585 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CltaO08585 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CltaO08585 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CltaO08585 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CltaO08585 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CltaO08585 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CltaO08585 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CltaO08585 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CltaO08585 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CltaO08585 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CltaO08585 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CltaO08585 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CltaO08585 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CltaO08585 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CltaO08585 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CltaO08585 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CltaO08585 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CltaO08585 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CltaO08585 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CltaO08585 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CltaO08585 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CltaO08585 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CltaO08585 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CltaO08585 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CltaO08585 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CltaO08585 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CltaO08585 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CltaO08585 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CltaO08585 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CltaO08585 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CltaO08585 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CltaO08585 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CltaO08585 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CltaO08585 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CltaO08585 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.4 ms