Protein–RNA interactions for Protein: O08583

Alyref, THO complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlyrefO08583 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AlyrefO08583 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms