Protein–RNA interactions for Protein: O08542

Efna4, Ephrin-A4, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna4O08542 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Efna4O08542 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Efna4O08542 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Efna4O08542 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Efna4O08542 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna4O08542 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna4O08542 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Efna4O08542 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Efna4O08542 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Efna4O08542 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efna4O08542 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna4O08542 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna4O08542 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms