Protein–RNA interactions for Protein: M0QW51

Gm17078, Predicted gene 17078, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17078M0QW51 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17078M0QW51 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17078M0QW51 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17078M0QW51 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17078M0QW51 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17078M0QW51 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17078M0QW51 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17078M0QW51 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17078M0QW51 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17078M0QW51 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17078M0QW51 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17078M0QW51 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17078M0QW51 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17078M0QW51 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17078M0QW51 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17078M0QW51 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17078M0QW51 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17078M0QW51 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17078M0QW51 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17078M0QW51 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17078M0QW51 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17078M0QW51 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17078M0QW51 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17078M0QW51 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17078M0QW51 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17078M0QW51 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17078M0QW51 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17078M0QW51 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17078M0QW51 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17078M0QW51 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms