Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ascl4M0QW46 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms