Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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