Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms