Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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