Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms