Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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