Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tubgcp6G5E8P0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tubgcp6G5E8P0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tubgcp6G5E8P0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Tubgcp6G5E8P0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Tubgcp6G5E8P0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tubgcp6G5E8P0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tubgcp6G5E8P0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tubgcp6G5E8P0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tubgcp6G5E8P0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tubgcp6G5E8P0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tubgcp6G5E8P0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tubgcp6G5E8P0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tubgcp6G5E8P0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tubgcp6G5E8P0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tubgcp6G5E8P0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tubgcp6G5E8P0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tubgcp6G5E8P0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tubgcp6G5E8P0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tubgcp6G5E8P0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Tubgcp6G5E8P0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Tubgcp6G5E8P0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tubgcp6G5E8P0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tubgcp6G5E8P0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tubgcp6G5E8P0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Tubgcp6G5E8P0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Tubgcp6G5E8P0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tubgcp6G5E8P0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tubgcp6G5E8P0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tubgcp6G5E8P0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tubgcp6G5E8P0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tubgcp6G5E8P0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tubgcp6G5E8P0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tubgcp6G5E8P0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tubgcp6G5E8P0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tubgcp6G5E8P0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tubgcp6G5E8P0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tubgcp6G5E8P0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tubgcp6G5E8P0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tubgcp6G5E8P0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tubgcp6G5E8P0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tubgcp6G5E8P0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tubgcp6G5E8P0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Tubgcp6G5E8P0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tubgcp6G5E8P0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tubgcp6G5E8P0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tubgcp6G5E8P0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tubgcp6G5E8P0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tubgcp6G5E8P0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tubgcp6G5E8P0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tubgcp6G5E8P0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tubgcp6G5E8P0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tubgcp6G5E8P0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tubgcp6G5E8P0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tubgcp6G5E8P0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tubgcp6G5E8P0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tubgcp6G5E8P0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tubgcp6G5E8P0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tubgcp6G5E8P0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tubgcp6G5E8P0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Tubgcp6G5E8P0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tubgcp6G5E8P0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tubgcp6G5E8P0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tubgcp6G5E8P0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tubgcp6G5E8P0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tubgcp6G5E8P0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tubgcp6G5E8P0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tubgcp6G5E8P0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tubgcp6G5E8P0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tubgcp6G5E8P0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tubgcp6G5E8P0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tubgcp6G5E8P0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Tubgcp6G5E8P0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tubgcp6G5E8P0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tubgcp6G5E8P0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tubgcp6G5E8P0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tubgcp6G5E8P0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tubgcp6G5E8P0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tubgcp6G5E8P0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tubgcp6G5E8P0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tubgcp6G5E8P0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tubgcp6G5E8P0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tubgcp6G5E8P0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tubgcp6G5E8P0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Tubgcp6G5E8P0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tubgcp6G5E8P0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tubgcp6G5E8P0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tubgcp6G5E8P0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tubgcp6G5E8P0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Tubgcp6G5E8P0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Tubgcp6G5E8P0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Tubgcp6G5E8P0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tubgcp6G5E8P0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tubgcp6G5E8P0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tubgcp6G5E8P0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tubgcp6G5E8P0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tubgcp6G5E8P0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tubgcp6G5E8P0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tubgcp6G5E8P0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tubgcp6G5E8P0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms