Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G1

Vmn1r12, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r12G5E8G1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r12G5E8G1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms