Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Pcf11G3X9Z4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms