Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms