Protein–RNA interactions for Protein: G3UY57

Trim15, Tripartite motif protein 15, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim15G3UY57 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Trim15G3UY57 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms