Protein–RNA interactions for Protein: G3UW59

Ubap1l, MCG16443, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubap1lG3UW59 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubap1lG3UW59 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubap1lG3UW59 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubap1lG3UW59 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubap1lG3UW59 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubap1lG3UW59 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubap1lG3UW59 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubap1lG3UW59 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubap1lG3UW59 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubap1lG3UW59 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubap1lG3UW59 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubap1lG3UW59 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubap1lG3UW59 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubap1lG3UW59 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubap1lG3UW59 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubap1lG3UW59 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubap1lG3UW59 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubap1lG3UW59 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubap1lG3UW59 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubap1lG3UW59 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubap1lG3UW59 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubap1lG3UW59 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubap1lG3UW59 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubap1lG3UW59 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubap1lG3UW59 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubap1lG3UW59 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubap1lG3UW59 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubap1lG3UW59 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubap1lG3UW59 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubap1lG3UW59 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubap1lG3UW59 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubap1lG3UW59 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubap1lG3UW59 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubap1lG3UW59 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubap1lG3UW59 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubap1lG3UW59 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubap1lG3UW59 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubap1lG3UW59 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubap1lG3UW59 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubap1lG3UW59 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubap1lG3UW59 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubap1lG3UW59 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ubap1lG3UW59 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ubap1lG3UW59 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ubap1lG3UW59 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ubap1lG3UW59 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubap1lG3UW59 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubap1lG3UW59 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubap1lG3UW59 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubap1lG3UW59 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubap1lG3UW59 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubap1lG3UW59 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubap1lG3UW59 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubap1lG3UW59 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubap1lG3UW59 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubap1lG3UW59 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubap1lG3UW59 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubap1lG3UW59 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubap1lG3UW59 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubap1lG3UW59 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubap1lG3UW59 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubap1lG3UW59 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubap1lG3UW59 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubap1lG3UW59 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubap1lG3UW59 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubap1lG3UW59 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubap1lG3UW59 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubap1lG3UW59 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubap1lG3UW59 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubap1lG3UW59 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubap1lG3UW59 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubap1lG3UW59 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubap1lG3UW59 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubap1lG3UW59 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubap1lG3UW59 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubap1lG3UW59 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubap1lG3UW59 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubap1lG3UW59 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubap1lG3UW59 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubap1lG3UW59 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubap1lG3UW59 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubap1lG3UW59 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubap1lG3UW59 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubap1lG3UW59 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubap1lG3UW59 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubap1lG3UW59 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubap1lG3UW59 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubap1lG3UW59 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubap1lG3UW59 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubap1lG3UW59 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubap1lG3UW59 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubap1lG3UW59 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubap1lG3UW59 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubap1lG3UW59 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubap1lG3UW59 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubap1lG3UW59 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubap1lG3UW59 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubap1lG3UW59 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubap1lG3UW59 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubap1lG3UW59 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms