Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms