Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms