Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm28048F7BCN0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms