Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
D430041D05RikF6ZGR6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
D430041D05RikF6ZGR6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
D430041D05RikF6ZGR6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
D430041D05RikF6ZGR6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
D430041D05RikF6ZGR6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
D430041D05RikF6ZGR6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
D430041D05RikF6ZGR6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
D430041D05RikF6ZGR6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
D430041D05RikF6ZGR6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
D430041D05RikF6ZGR6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
D430041D05RikF6ZGR6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
D430041D05RikF6ZGR6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
D430041D05RikF6ZGR6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
D430041D05RikF6ZGR6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
D430041D05RikF6ZGR6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
D430041D05RikF6ZGR6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
D430041D05RikF6ZGR6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
D430041D05RikF6ZGR6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
D430041D05RikF6ZGR6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
D430041D05RikF6ZGR6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
D430041D05RikF6ZGR6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
D430041D05RikF6ZGR6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
D430041D05RikF6ZGR6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
D430041D05RikF6ZGR6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
D430041D05RikF6ZGR6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
D430041D05RikF6ZGR6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
D430041D05RikF6ZGR6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
D430041D05RikF6ZGR6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
D430041D05RikF6ZGR6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
D430041D05RikF6ZGR6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
D430041D05RikF6ZGR6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
D430041D05RikF6ZGR6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
D430041D05RikF6ZGR6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
D430041D05RikF6ZGR6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
D430041D05RikF6ZGR6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
D430041D05RikF6ZGR6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
D430041D05RikF6ZGR6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
D430041D05RikF6ZGR6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
D430041D05RikF6ZGR6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
D430041D05RikF6ZGR6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
D430041D05RikF6ZGR6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
D430041D05RikF6ZGR6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
D430041D05RikF6ZGR6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
D430041D05RikF6ZGR6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
D430041D05RikF6ZGR6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
D430041D05RikF6ZGR6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
D430041D05RikF6ZGR6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
D430041D05RikF6ZGR6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
D430041D05RikF6ZGR6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
D430041D05RikF6ZGR6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
D430041D05RikF6ZGR6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
D430041D05RikF6ZGR6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
D430041D05RikF6ZGR6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
D430041D05RikF6ZGR6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
D430041D05RikF6ZGR6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
D430041D05RikF6ZGR6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
D430041D05RikF6ZGR6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
D430041D05RikF6ZGR6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
D430041D05RikF6ZGR6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
D430041D05RikF6ZGR6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
D430041D05RikF6ZGR6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
D430041D05RikF6ZGR6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
D430041D05RikF6ZGR6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
D430041D05RikF6ZGR6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
D430041D05RikF6ZGR6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
D430041D05RikF6ZGR6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
D430041D05RikF6ZGR6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
D430041D05RikF6ZGR6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
D430041D05RikF6ZGR6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
D430041D05RikF6ZGR6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
D430041D05RikF6ZGR6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
D430041D05RikF6ZGR6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
D430041D05RikF6ZGR6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
D430041D05RikF6ZGR6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
D430041D05RikF6ZGR6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
D430041D05RikF6ZGR6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
D430041D05RikF6ZGR6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
D430041D05RikF6ZGR6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
D430041D05RikF6ZGR6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
D430041D05RikF6ZGR6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
D430041D05RikF6ZGR6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
D430041D05RikF6ZGR6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
D430041D05RikF6ZGR6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
D430041D05RikF6ZGR6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
D430041D05RikF6ZGR6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
D430041D05RikF6ZGR6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
D430041D05RikF6ZGR6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
D430041D05RikF6ZGR6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
D430041D05RikF6ZGR6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
D430041D05RikF6ZGR6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
D430041D05RikF6ZGR6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms