Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sptbn5F6UCX4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sptbn5F6UCX4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sptbn5F6UCX4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sptbn5F6UCX4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sptbn5F6UCX4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sptbn5F6UCX4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sptbn5F6UCX4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sptbn5F6UCX4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sptbn5F6UCX4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sptbn5F6UCX4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sptbn5F6UCX4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sptbn5F6UCX4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Sptbn5F6UCX4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sptbn5F6UCX4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sptbn5F6UCX4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sptbn5F6UCX4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sptbn5F6UCX4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sptbn5F6UCX4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sptbn5F6UCX4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sptbn5F6UCX4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sptbn5F6UCX4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sptbn5F6UCX4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sptbn5F6UCX4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms