Protein–RNA interactions for Protein: F6S200

Plekhg1, Pleckstrin homology domain-containing, family G (with RhoGef domain) member 1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plekhg1F6S200 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plekhg1F6S200 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plekhg1F6S200 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plekhg1F6S200 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plekhg1F6S200 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plekhg1F6S200 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plekhg1F6S200 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plekhg1F6S200 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plekhg1F6S200 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plekhg1F6S200 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plekhg1F6S200 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plekhg1F6S200 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plekhg1F6S200 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Plekhg1F6S200 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Plekhg1F6S200 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Plekhg1F6S200 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Plekhg1F6S200 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Plekhg1F6S200 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Plekhg1F6S200 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Plekhg1F6S200 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Plekhg1F6S200 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Plekhg1F6S200 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Plekhg1F6S200 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Plekhg1F6S200 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Plekhg1F6S200 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Plekhg1F6S200 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Plekhg1F6S200 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Plekhg1F6S200 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Plekhg1F6S200 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Plekhg1F6S200 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Plekhg1F6S200 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Plekhg1F6S200 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Plekhg1F6S200 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Plekhg1F6S200 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Plekhg1F6S200 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Plekhg1F6S200 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Plekhg1F6S200 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Plekhg1F6S200 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Plekhg1F6S200 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Plekhg1F6S200 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Plekhg1F6S200 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Plekhg1F6S200 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Plekhg1F6S200 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Plekhg1F6S200 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Plekhg1F6S200 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Plekhg1F6S200 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Plekhg1F6S200 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Plekhg1F6S200 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Plekhg1F6S200 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Plekhg1F6S200 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Plekhg1F6S200 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Plekhg1F6S200 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Plekhg1F6S200 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Plekhg1F6S200 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Plekhg1F6S200 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Plekhg1F6S200 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Plekhg1F6S200 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Plekhg1F6S200 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Plekhg1F6S200 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Plekhg1F6S200 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Plekhg1F6S200 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Plekhg1F6S200 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Plekhg1F6S200 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Plekhg1F6S200 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Plekhg1F6S200 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Plekhg1F6S200 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Plekhg1F6S200 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Plekhg1F6S200 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Plekhg1F6S200 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Plekhg1F6S200 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Plekhg1F6S200 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Plekhg1F6S200 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Plekhg1F6S200 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Plekhg1F6S200 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Plekhg1F6S200 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Plekhg1F6S200 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Plekhg1F6S200 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Plekhg1F6S200 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Plekhg1F6S200 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Plekhg1F6S200 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Plekhg1F6S200 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Plekhg1F6S200 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Plekhg1F6S200 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Plekhg1F6S200 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Plekhg1F6S200 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Plekhg1F6S200 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Plekhg1F6S200 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Plekhg1F6S200 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Plekhg1F6S200 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Plekhg1F6S200 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Plekhg1F6S200 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Plekhg1F6S200 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Plekhg1F6S200 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Plekhg1F6S200 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Plekhg1F6S200 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Plekhg1F6S200 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Plekhg1F6S200 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Plekhg1F6S200 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Plekhg1F6S200 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Plekhg1F6S200 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms